“แต่งกลิ่นธรรมชาติ” (Natural Flavor) หมายถึงการใช้สารแต่งกลิ่นที่ได้จากวัตถุดิบธรรมชาติ ทั้งพืช สัตว์ หรือจุลินทรีย์ ผ่านกระบวนการทางกายภาพ เอนไซม์ หรือการหมัก เช่น การสกัด การกลั่น หรือการคั่ว ตามแนวทางเรื่องสารแต่งกลิ่นของโคเด็กซ์ สารแต่งกลิ่นธรรมชาติอาจมาจากอาหารชนิดเดียวกับกลิ่นนั้น เช่น สารสกัดวานิลลาในครีมวานิลลา แต่ไม่จำเป็นเสมอไป กลิ่นคล้ายสตรอว์เบอร์รีอาจสร้างจากแหล่งธรรมชาติอื่นก็ได้
กฎหมายไทยกำหนดให้ฉลากแสดงว่าแต่งกลิ่นแบบใด ซองขนมจึงแยก “แต่งกลิ่นธรรมชาติ” ออกจาก “แต่งกลิ่นเลียนธรรมชาติ” และ “แต่งกลิ่นสังเคราะห์” และมันฝรั่งทอดหลายยี่ห้อก็ระบุไว้สองหรือสามแบบพร้อมกัน เช่น เลย์ สแตคส์ รสมันฝรั่งออริจินัล ที่ระบุทั้งแต่งกลิ่นธรรมชาติและแต่งกลิ่นเลียนธรรมชาติ
สารแต่งกลิ่นธรรมชาติอาจมาจากนม อาหารทะเล เนื้อสัตว์ หรือแหล่งอื่น คำนี้เพียงอย่างเดียวจึงไม่ได้บอกผู้ทานมังสวิรัติหรือผู้มีอาการแพ้ว่ามีอะไรอยู่ ข้อมูลสารก่อภูมิแพ้บนซองเป็นแหล่งที่เชื่อถือได้มากกว่า
